Lương của cán bộ do ngân sách nhà nước chi trả sẽ không bị giảm vì lý do cán bộ đó được cử biệt phái/kiêm nhiệm làm việc cho Dự án.
Dự án không trả lương cho cán bộ của Sở làm kiêm nhiệm cho Dự án mà chỉ trả phụ cấp tương ứng với khoảng thời gian cán bộ đó tham gia các hoạt động của Dự án. Khoản phụ cấp này được tính trên cơ sở lương cơ bản, các hệ số cán bộ đó được hưởng và % thời gian tham gia Dự án.
Các khoản phụ cấp cho cán bộ kiêm nhiệm của Sở không phải tính bằng phụ cấp làm thêm (thường được hiểu là làm ngoài giờ làm việc thông thường) mà được tính dựa trên thời gian thực tế cán bộ đó tham gia vào quá trình thực hiện Dự án. Thời gian đó có thể vẫn là trong giờ hành chính.
Ví dụ:
Một cán bộ dành mỗi ngày 2h để tham gia làm việc của Dự án, tương đương với 25% thời gian làm việc một ngày (tính trên cơ sở ngày làm việc 8h). Cán bộ đó đang được hưởng hệ số cấp bậc 3,4 và hệ số khu vực 0,5 theo chế độ lương của Nhà nước. Vậy phụ cấp hàng tháng trích từ ngân sách Dự án trả cho cán bộ đó là:
450.000 (lương cơ bản theo quy định của nhà nước) x (3,4 + 0,5) x 25% = 438.750 VND
Việc hưởng lương và phụ cấp theo chế độ và định mức của EC chỉ áp dụng cho các trường hợp được tuyển mới thông qua các hợp đồng lao động ngắn hạn (chuyên gia tư vấn, giảng viên cho các khoá tập huấn, đào tạo) hoặc dài hạn (nhân viên dự án được tuyển từ thị trường lao động tự do làm việc toàn thời gian cho Dự án).
Các chuyên gia tư vấn hoặc giảng viên được Dự án tuyển dụng và trả lương cho từng nhiệm vụ cụ thể phải đảm bảo không hưởng lương nhà nước trong thời gian làm việc cho Dự án, và có trách nhiệm cung cấp giấy tờ, bằng chứng hợp lệ chứng minh cho việc đó.